Das genaue Gründungsjahr des Wat Lok Molee ist unbekannt.
Er wird jedoch erstmals 1367 erwähnt, als König Kuena (1355 - 1385), der 6. König der Mangrai-Dynastie, 10 buddhistische Mönche aus Burma dorthin eingeladen hatte, um ihre Lehre des Theravada-Buddhismus zu verbreiten.
1527 gab König Ket den Bau des Chedi in Auftrag und ließ im Jahr 1545 auch einen Viharn errichten.
Von dem ursprünglichen Gebäude des Viharn ist allerdings nur noch das Ziegelfundament erhalten.
Bis zum Untergang ihrer Dynastie (die das Lanna-Königreich vom Ende des 13. Jahrhunderts bis 1558 regierte) wurde im Wat Lok Molee, der ein königlicher Tempel war, die Asche mehrerer Mitglieder der königlichen Familie beerdigt.
Nach der Eroberung und während der über 200 jährigen Herrschaft der Burmesen, die bis zum Ende des 18. Jahrhunderts andauerte, wurde die Stadt Chiang Mai aufgegeben und verfiel, ebenso wie der Wat Lok Molee, mehr und mehr.
Erst in der zweiten Hälfte des 20. Jahrhunderts erfolgte dann Zug um Zug eine Restaurierung der Tempel-Anlage.